一些神奇宝贝化石的历史可以追溯到数亿年前。知道它们所基于的生物可以更清楚地了解其确切年龄。
多大了 复活到史前的化石 宠物小精灵 像阿曼吗？它们存在于第一代之前的数百万年。知道它们从中汲取灵感的真实生物，并将其与系列中的信息相结合，玩家可以对每种神奇宝贝化石的年龄进行有根据的猜测。
像现实生活一样，化石遍布整个世界 宠物小精灵 世界。使他们在游戏中与众不同的是，他们有能力重拾真正的神奇宝贝-过去的活物。德文郡公司（Devon Corporation），朱砂实验室（Cinnabar Lab）和世界各地的其他科学家都能够执行恢复这些缺陷所需的技术 宠物小精灵 化石 。
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这些化石神奇宝贝所基于的生物是从 斗牛场 网站，以及 不列颠百科全书 用于确定所述生物的年龄。 Bulbapedia还提供了有关特定化石神奇宝贝何时首次出现在该宇宙中的一些背景信息：大约1亿年前，灭绝灵，Lileep，Cranidos，Shieldon，Tirtouga，Archen，Tyrunt的进化Tyrantrum和Amaura特别灭绝。
神奇宝贝化石：螺旋线，旧琥珀和圆顶
螺旋和圆顶化石分别复活为阿曼特（Omanyte）和卡布托（Kabuto）。阿曼尼特是基于泥盆纪至白垩纪（6600万至4.19亿年）的铵盐。 Kabuto的设计基于三叶虫，它最早出现在大约5.42亿年前的寒武纪时期，而马蹄蟹是三叶虫的后代，至今仍然可以找到。 Bulbapedia指出 宠物小精灵卡布托 存在于大约3亿年前。老琥珀基于飞行的爬行动物-翼龙-可以追溯到侏罗纪时期（1.59亿到1.44亿）恢复到Aerodactyl。
神奇宝贝化石：根与爪
Lileep从根化石中复活。它的设计基于可追溯到中晚期古生代时代（4.43亿到2.52亿年）的海百合。爪状化石恢复为安诺里斯（Anorith），后者也具有三叶虫特征。它源自寒武纪（5.6亿年）的异常。尽管Relicanth并非像其他化石一样从化石中复活，但它的设计和描述是“活化石”，暗示着腔棘鱼鱼类。腔棘鱼从其3.5亿年前的史前形态（二叠纪末期到侏罗纪末期）几乎没有变化。 Bulbapedia注意到 神奇宝贝遗物 一亿年没有改变。
神奇宝贝化石：头骨与盔甲
头骨化石恢复成Cranidos，Bulbapedia推测这与白垩纪（146至6600万年）的角顶龙恐龙的代表有关。 Shieldon（Armor Fossil）类似于Protoceratops属，也是白垩纪更广为人知的Triceratops的前身。
神奇宝贝化石：覆盖物和羽状物
提尔图加（Tirtouga）从盖化石（Cover Fossil）复活，酷似如今和远至侏罗纪晚期（约1.5亿年）仍然存在的棱皮龟。 Plume Fossil使Archen复活，从始祖鸟（Arcedopteryx）汲取灵感。始祖鸟是羽毛恐龙的一种，其历史可追溯至侏罗纪晚期。
神奇宝贝化石：下颚和帆
侏罗纪晚期（1.5亿年）的暴龙给了从颚化石恢复的神奇宝贝Tyrunt带来了灵感。蒂伦特眼睛上方的橙色峰类似于白垩纪晚期（99至6600万年）的G龙。帆化石复兴了以蜥脚类恐龙为基础的Amaura，该恐龙在侏罗纪初期（201至1.74亿年）首次进化。
神奇宝贝融合化石：化石的鸟，德雷克，恐龙和鱼
第8代提供了四种化石-比任何上一代都多。此外，必须将两种化石组合在一起以形成嵌合的化石神奇宝贝，而Bulbapedia的假设则可能是基于一系列错位的恐龙雕塑，即水晶宫恐龙。因此，它们每个都包含多个物种的特征。结合鸟类和德雷克化石使德拉科佐特复活。下半部分类似于白垩纪的屈毛龙（145至6000万年），下半部分类似于侏罗纪晚期（159至1.44亿年）的剑龙。
鸟类和迪诺化石复兴了 精灵宝可梦 这可能是指在陆地上行走的鱼龙。这些灭绝的水生爬行动物化石保留在中生代大部分时期（251至6500万年）。上半部分可能基于屈毛龙科。鱼和德雷克化石重振了具有剑龙和剑龙品质的德拉科维什（Dracovish）。板龙是白垩纪晚期的一种蛇颈龙。像Relicanth一样，它也让人联想到腔棘鱼。鱼和恐龙化石重现了Arctovish-泥盆纪晚期（375至3.6亿年）的Dunkleosteus，腔棘鱼和蛇颈龙的组合。尽管在1996年推出， 宠物小精灵 在化石历史上已经有数百万年的历史了。