尽管 神秘博士 早期的几季让这部经典剧集大放异彩，前 253 集中的许多剧集都完全丢失了。第一和第二博士的大部分任期都因剧集缺失而受到损害，尽管这些故事在 1960 年代播出，但在首次播放后就无法观看。虽然对缺失剧集中出现的故事仍有很多了解，但现代观众无法欣赏分期付款的实物印刷品和磁带。流媒体服务 BritBox 收录了经典的每一集 神秘博士 ，但传奇科幻剧的早期仍然存在很大差距。
总计97集 神秘博士 下落不明，包括几个尚未恢复的完整系列。尽管 丢失的剧集可能对 神秘博士 从叙事的意义上讲，该剧早期的不完整性质代表了该系列重要历史中的一个明显漏洞。 神秘博士 已经成为一种真正的文化现象，缺失的剧集削弱了它的遗产。虽然经典 神秘博士 这并不是英国电视历史上那个时期唯一缺少剧集的节目，它引起了粉丝和历史学家等人的最大反响之一。
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BBC 摧毁了老神秘博士剧集
在 1960 年代，“垃圾”的做法在英国电视中非常普遍，著名的连续剧如 复仇者 不能幸免于被扔掉。 “Junking”指的是在最初播出后有意删除和处理旧的存档节目。这种做法是为了节省空间和金钱，因为旧磁带被重复使用，并且重复使用减少了旧剧集所需的存储量（通过 牙线 ).第二任博士的第一个故事让他面对了 Daleks，但即使是那个经典故事也被处理掉了。没有联合发行权，就没有理由在播出后保留旧剧集。
那个时代的所有录音带都曾一度丢失，但许多录音带通过电影副本得以保存下来。第一博士的第一季和第二季几乎毫发无损地幸存下来，但该剧的第三季、第四季和第五季遭受的损失最为惨重。 10 个完整的连续剧被彻底抹去，包括像这样的故事 马可波罗 和 达勒克斯的力量 ，后者是帕特里克·特劳顿 (Patrick Troughton) 的第一个完整故事。总体而言，有 26 部连续剧出现了缺失的剧集 神秘博士 播出的第一个五年。 BBC 在 1978 年放弃了“垃圾邮件”的做法，但损害已经造成。
丢失的情节已被恢复并重新创建
新时代 神秘博士 对第一位医生的痴迷与该剧丢失剧集的谜团有很大关系，人们齐心协力恢复被删除的内容。虽然许多丢失的故事是通过录音带的电影版本找到的，但其他故事是从档案馆和私人收藏中找回的。有趣的是，最近开始通过动画重新制作缺失的剧集，从而填补了空白。都是经典 神秘博士 的音轨幸存下来，并且在幸存的剧照的帮助下，动画师已经开始以动态图像的形式将丢失的故事带入生活，因为它们本来是要被看到的。
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