神奇宝贝游戏的每个版本都有只能在一种或另一种游戏中获得的物种，从而鼓励玩家与朋友进行一些交易。
每一代 宠物小精灵 拥有版本专有的物种，玩家只能在一种或另一种游戏中获得。这包括新的和过去的神奇宝贝，以及游戏特有的传奇神奇宝贝。一些玩家购买他们的 宠物小精灵 游戏版本基于特定的神奇宝贝，因为某些游戏对玩家而言比其他游戏更有价值。但是，如果每个版本都有一个球员想要的球队品种，则可能会很困难，从而使球员们希望以他们错过的神奇宝贝为名进行交易。
游戏可能会在系列的每个区域的版本之间拆分某些神奇宝贝，这似乎令人沮丧。这可能是尝试让玩家加入 购买两个版本的 宠物小精灵 游戏 ，以现代为基础的理论 宠物小精灵 游戏通常可以选择捆绑购买。另一种可能性是游戏开发人员希望鼓励玩家在朋友之间进行交易以完成他们的Pokédex。
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某些特定于游戏的神奇宝贝比其他种类更受追捧。以下列出了每一代中新增的最佳神奇宝贝，不包括传奇人物 宠物小精灵 ，以帮助玩家确定他们可能想选择并玩哪个版本的游戏。这对于购买了移植到3DS的较早游戏的玩家来说尤其有用，例如 神奇宝贝红色和蓝色 ，以提供他们在该地区旅行时应该注意的热门神奇宝贝的想法。
最佳版本-独家神奇宝贝：红色和蓝色
- 神奇宝贝红 -关东地区最好的版本 网 是《神奇宝贝》中火系迷的最爱。奥格琳（Growlithe）的进化，是抢取副本的重要原因 神奇宝贝红 。
- 神奇宝贝蓝 - 尽管 神奇宝贝红 有最好的火小狗 神奇宝贝蓝 最好的版本除外的神奇宝贝恰好是九尾狐狸Ninetails。虽然这两个版本都有强大的射击类型，但选择合适的游戏完全取决于偏好。
最佳版本-独家神奇宝贝：黄金和白银
- 神奇宝贝金 -Johto推出了一些新的神奇宝贝供玩家使用，对于那些想要功能强大的Normal类型的玩家来说，金色独家熊Urasring可能是一个不错的选择。凭借强大的攻击力和可爱的进化前的泰迪厄尔萨（Teddiursa），对于玩家团队而言，乌萨辛（Ursaring）是一款有趣的神奇宝贝。
- 神奇宝贝银 -第二代为神奇宝贝引入了新的类型，如果玩家想要钢铁/飞行类型， 神奇宝贝银子 如果他们有合适的比赛，Skarmory是一个不错的选择。然而，让一只更好的神奇宝贝鸟神奇宝贝被锁定在一场比赛中绝对令人沮丧，这限制了有多少玩家能够接住它。
最佳版本-独家神奇宝贝：红宝石和蓝宝石
- 神奇宝贝红宝石 -霍恩地区并没有增加很多地区独有的神奇宝贝，但毛利人是玩家可能想尝试的地方。在原来的 红宝石 在版本中，Mawile仅是钢制型号，看上去与其他重型装甲和重型钢制设计截然不同。
- 神奇宝贝蓝宝石 - 球迷寻找一个强大的类型组合可能已经伤心错过Sableye如果他们碰巧挑 红宝石 超过 蓝宝石。 Dark / Ghost类型的Pokémon拥有令人毛骨悚然的设计和强大的移动装置，具有犯规和影子球之类的攻击能力。
最佳版本-独家神奇宝贝：钻石和珍珠
- 神奇宝贝钻石 -添加到的最佳新神奇宝贝 神奇宝贝钻石 是版本专属的化石神奇宝贝Rampardos。摇滚类型为受恐龙启发的神奇宝贝迷提供了另一个添加到其团队中的选择。 Rampardos是 化石神奇宝贝的卓越设计 在两个版本之间也是如此。
- 神奇宝贝珍珠 -对于第二代可爱的Dark / GhostPokémonMisdreavus的粉丝， 神奇宝贝珍珠 为玩家提供了一个抓住机会并将其发展为误导者的机会。虽然它失去了Dark类型，但此GhostPokémon的恐怖设计使其成为Ghost-lover团队的有趣补充。
最佳版本-独家神奇宝贝：黑白
- 神奇宝贝黑 -第五代对于神奇宝贝的设计来说是艰难的时期，乌诺瓦地区增加了一大堆毫无灵感的物种。但是，这是一个特别有竞争力的 宠物小精灵 一代的草型粉丝。 Whimsicott是Cottonee的进化形式，是一种可爱的草型，接缝是用绒毛球和公羊制成的。
- 神奇宝贝白 -但是，版本独占方式给草师带来了一个艰难的选择，因为 神奇宝贝珍珠 挑战 布莱克的 异想天开与美丽的草神奇宝贝Lilligant。两种神奇宝贝都为可用的草类提供了急需的功能，并且在选择版本时为玩家提供了艰难的选择。
最佳版本-独家神奇宝贝：X和Y
- 神奇宝贝X -Kalos地区引入了该系列的新类型。由于这个原因，仙女型神奇宝贝Slurpuff被添加到 神奇宝贝X 。虽然它不是最可爱的仙女型，但它具有平衡的举动，无需HM即可学习许多草式举动和黑暗式举动。这使其成为球员团队的全面选择。
- 神奇宝贝Y -拿到副本的玩家 神奇宝贝Y 当他们遇到Skrelp时得到了一种治疗，像水/毒药版本的Horsea这样的Algea。但是，当Skrelp演变成毒药/龙型的Dragalge时，真正的惊喜就来了。真正令人沮丧的是，这种功能强大的组合仅限于游戏的一个版本，使其成为许多人都想交易的神奇宝贝。
最佳版本-神奇宝贝：太阳与月亮
- 神奇宝贝太阳 -阿罗拉（Alola）地区引入了基于地区0设计变体的神奇宝贝。球迷玩 神奇宝贝太阳 能够找到冰冷的Vulpix版本，而这款Alolan Vulpix演变为冰/仙女型Alolan Ninetails。这种美丽的Alola形式绝对值得在版本和障碍之间进行交易。
- 神奇宝贝月亮 -龙型神奇宝贝的粉丝有机会在 神奇宝贝月亮 。它是唯一一款在所有游戏中都输入普通/龙的龙宝可梦，这对于喜欢养成不同龙形宝可梦的人来说，是一个有趣的补充。
最佳版本-独家神奇宝贝：剑与盾
- 神奇宝贝剑 -Galar地区在《Pokédex》中为粉丝添加了许多新的《Pokémon》，但最令人沮丧的版本《Pokémon》设计却为 剑与盾 可爱的苹果龙Flapple和Appletun。玩家只能使用Tart Apple获得Flapple，这是Applin的演变 神奇宝贝剑 。 art苹果是在野生地区可以找到的稀有物品。
- 神奇宝贝盾 -Applin的另一种进化形式是Appletun。该苹果派龙仅限于 神奇宝贝盾 ，玩家可以在荒野中找到“甜苹果”。就像其他神奇宝贝一样，由于每个游戏版本中的物品所限，进化分支受到限制，玩家必须在交易过程中寻找一位朋友来交换苹果，才能在一个游戏中同时拥有两者。